¿Qué es Agouti?

Agouti es una plataforma web diseñada para apoyar proyectos locales dentro de cada país piloto, donde el objetivo es utilizar los avistamientos de mamíferos para estimar el número y la distribución de las diferentes especies.

Generalmente esto se hace por profesionales, expertos en naturaleza y voluntarios entrenados que tienen acceso a un número de cámaras. Si las cámaras están configuradas de acuerdo con los protocolos de ENETWILD, los datos pueden utilizarse para estimar sistemáticamente densidades de mamíferos.

Autor: P Palencia/SaBio-IREC

¿Por qué debería usarla?

Ayúdanos utilizando tus imágenes de cámara trampa para resolver cuestiones importantes sobre las poblaciones de mamíferos.

Agouti utiliza una interfaz moderna, orientada a mejorar la eficacia en la gestion de imágenes de fototrampeo . Cualquiera puede utilizarla con un poco de entrenamiento. Hay vídeo-tutoriales disponibles donde se explican los diferentes aspectos del sistema.

La plataforma trabaja en colaboración con todos los usuarios para gestionar eficientemente los datos que entran.

Los datos se organizan según formatos estandarizados y pueden añadirse a archivos abiertos u otro software para su análisis a posteriori.

Puedes utilizar la plataforma para entrenar a tu propio grupo de colaboradores o para trabajar con otros investigadores.

¿Cuáles son los beneficios de su uso?

Nuestros conocimientos sobre la mayoría de los mamaíferos son todavía limitados. Aunque existen estudios muy detallados sobre la biología de los mamíferos, la información tiende a concentrarse en áreas naturales muy pequeñas. Es importante ampliar este punto de vista local, para obtener información de los mamíferos en su entorno más amplio.

  • Gracias a la información compartida por ciudadanos científicos como tú, podemos comprender mejor la distribución epsacial y temporal de de una amplia variedad de mamíferos
  • Esta información nos ayuda a comprender mejor la influencia del cambio climático y de las actividades humanas en los patrones de distribución y presencia de especies alóctonas o invasoras. Los mamíferos silvestres también influyen en la transmisión de enfermedades que afectan al ganado y al humano, por lo que un mejor conocimiento de estas especies puede ayudar a la toma de decisiones basadas en la evidencia para la reducción del riesgo..
  • Cuando recopilamos suficientes avistamientos a través de la información que suben los usuarios, no sólo podemos ver qué especies están presentes, sino que también podemos tener una mejor idea de qué especies están ausentes en cada región. Esta información es muy importante para entender y predecir con precisión la distribución de las especies y se utilizará para crear el próximo Atlas Europeo de Mamíferos..

La información que nos envíe se verificará con ayuda de expertos y otros miembros de la comunidad científica. La información validada se enviará a un archivo centralizado del Global Biodiversity Information Facility (GBIF) y de la Autoridad Europea de Seguridad Alimentaria (EFSA) y todos los investigadores y los responsables de la vida silvestre de todo el mundo podrán utilizarla para responder preguntas de investigación y conservación presentes y futuras.

¿Por qué GBIF?

GBIF (Global Biodiversity Information Facility)es una red internacional y una fundación de investigación financiada por gobiernos de todo el mundo, cuyo objetivo es proporcionar a cualquier persona y en cualquier lugar, acceso a datos sobre todos los tipos de vida en la Tierra.

Una parte importante de la misión de GBIF es promover una cultura en la que la gente pueda reconocer los beneficios de publicar datos de biodiversidad de libre acceso, tanto para ellos mismos como para la comunidad en general.

Al hacer que tu información sea accesible con GBIF y otras redes de información sobre biodiversidad, contribuirás al conocimiento de la biodiversidad a nivel global así como a la generación de soluciones que promueven la conservación y uso sostenible de la misma.

Al poner tu información a disposición del público puedes combinar conjuntos de datos de todo el mundo, de modo que podrás trabajar junto a otros investigadores en tareas relacionadas con un objetivo común.

¿Por qué EFSA?

La Autoridad Europea de Seguridad Alimentaria (EFSA) proporciona a la Comisión Europea y al público en general, recomendaciones científicas independientes sobre seguridad alimentaria y riesgos en la cadena alimentaria. EFSA utilizará la información recopilada sobre abundancia y distribución de mamíferos silvestres para evaluar el riesgo de enfermedades que afectan a la fauna silvestre, al ganado y al ser humano.

¿Cómo utilizarla?

Agouti está diseñada para facilitar la gestión y el procesamiento de imágenes y datos recogidos por cámaras trampa. El objetivo final es recoger datos, estandarizar anotaciones y ponerlos a disposición de la comunidad científica en general. Agouti alberga una colección de proyectos de organizaciones y personas individuales. Los proyectos son colecciones de series de fotos/videos que provienen de una sola cámara trampa en una sola ubicación, que comparten entre ellos un cietrto protocolo.

En los proyectos trabajan sus participantes, definidos entre seis roles diferentes. El nivel más alto es el de Investigador Principal, que tiene el control total del proyecto, y el más bajo es el de Voluntario, que sólo puede anotar las fotos que ya han sido subidas. Un usuario puede tener diferentes roles en diferentes proyectos. Los contenidos de los proyectos no son visibles para los no participantes. Las decisiones de apropiación y de compartir se toman a nivel de proyecto.

Los participantes del proyecto cargan los datos de las tarjetas de memoria de sus cámaras trampa e introducen manualmente ubicación y otros metadatos. A continuación, Agouti importa las imágenes, extrae la fecha, la hora y otros datos y metadatos de las imágenes y utiliza las marcas de tiempo para agrupar las imágenes en secuencias que representan el mismo evento (por ejemplo, el paso de un animal). Las imágenes se pasan a través del reconocimiento automático de imágenes para identificar secuencias que contienen personas. Estas secuencias se dejan de lado por razones de privacidad. Las secuencias restantes son inspeccionadas por analistas que anotan cada una de ellas con una o más observaciones, utilizando una interfaz sencilla. Además se está trabajando en una interfaz para la validación de expertos.

Los datos se pueden exportar para su análisis en varios paquetes. Estamos introduciendo herramientas para visualizar los datos de cada proyecto en gráficos y tablas. Las imágenes y los datos se archivan de forma segura en un servidor de la universidad, se replican y se realizan copias de seguridad en dos centros de datos independientes y físicamente separados. Se añadirán enlaces para la transferencia de un archivo permanente (Zenodo) y a GBIF. Los propietarios de los proyectos pueden optar por poner los datos a disposición de los científicos para su investigación.

El proyecto se pondrá en marcha para que todos los datos estén disponibles automáticamente y puedan ser compartidos, además promovemos la contribución con GBIF o EFSA de forma explícita en el portal web

La interfaz de Agouti para la identificación de imágenes. El formulario de la derecha permite al ‘observador’ añadir una o más observaciones a cada secuencia de imágenes. El usuario puede desplazarse por las imágenes o reproducir la secuencia completa como un vídeo.

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